St-François-de-Pabos occupe une superficie de près de 45 km2 dans la partie sud de la MRC du Rocher-Percé, à environ 30 km de Percé. Son territoire est circonscrit par Pabos, Chandler et Grande-Rivière. La rivière du Petit Pabos coule au centre de cette étendue située à proximité de la Baie des Chaleurs.
On y retrouve un parc municipal situé près de l’ancien bureau municipal, un sentier pédestre qui longe la rivière du Petit Pabos dans le secteur du Pont Giroux et un sentier aménagé pour les véhicules tout-terrain.